本所設立目標為培育具有生物醫學及生物技術核心知識與能力的生命科學人才，因此確立設立宗旨如下：

1. 培育生物醫學及生物科技人材。

2. 奠定本校在生物醫學研究領域的基礎。

3. 強化本校在生物科技領域的整合。

4. 促進本校與高雄地區其他醫學相關機構的合作。